Como você está olhando para uma mistura bastante uniforme de tráfego de leitura/gravação, o InnoDB é a melhor escolha. Os bloqueios de tabela completa do MyISAM em cada gravação provavelmente seriam assassinato. O MyISAM se sai melhor com 90%+ de leitura ou 90%+ de situações de gravação.

Acredito que isso seja mencionado em MySQL de alto desempenho