Se você estiver usando apenas consultas "simples", não acho que haja muita diferença em relação ao uso de recursos entre o MySQL e, por exemplo, Oracle. Esses DBMS "profissionais" fazem muita "mágica" em relação ao cache, pré-busca e manutenção de dados. É claro que o MySQL também faz isso, mas pode não ser tão eficiente para bancos de dados realmente complexos e consultas avançadas.

Sua escolha de DBMS depende muito do que você planeja fazer, especialmente se estiver escolhendo entre SQL/NoSQL/Key-Value/..., que são para completamente cenários diferentes… isso não é tanto uma questão de memória e uso de CPU.