O comportamento que você mostrou acima na versão 5.5 era na verdade um bug. Isso foi corrigido em 5.6.11. Confira as notas da versão 5.6 .11 bem no fundo. Fazia parte dos bugs 68472 e 16394472 (para o qual não consigo encontrar um link).

Se você ativar o explicit_defaults_for_timestamp sinalizar, deve funcionar como em 5.5

Este foi exatamente o mesmo problema que tive com nosso banco de dados quando atualizamos de 5.5 para 5.6.