Para armazenar mais dados em cache:
innodb_buffer_pool_size = 512M
Se você escrever muitos dados:
innodb_log_file_size = 128M
, para evitar muita troca de log.
Não há terceiro que eu acrescentaria em qualquer caso, todos os outros dependem.
innodb_buffer_pool_size = 512M
innodb_log_file_size = 128M