http://www.maatkit.org/ tem mk-archiver
Outra alternativa é simplesmente criar uma nova tabela de banco de dados a cada dia. MyIsam tem algumas vantagens para isso, já que INSERTs no final da tabela geralmente não bloqueiam de qualquer maneira, e há um tipo de tabela de mesclagem para juntá-los novamente. Vários sites registram o tráfego httpd em tabelas como essa.
Com o Mysql 5.1, também existem tabelas de partição que podem fazer o mesmo.