Eu acredito que o pacote php-mysql está faltando no seu sistema. Instale o pacote usando o comando
sudo apt-get install php-mysql
Espero que isso resolva seu problema.
Acho que você precisa reiniciar o Apache também para corrigir o problema. Depois de instalar o php-mysql, use o seguinte comando para reiniciar o Apache
sudo service apache2 restart.
