Você pode transformar linhas em a coluna com GROUP_CONCAT , mas você não pode transpor conjuntos de resultados inteiros de maneira automática. Você escreve uma consulta que produz cada coluna manualmente ou faz isso em um aplicativo.

Aqui está um tutorial sobre como escrever as consultas complicadas para emular a transposição:

http://www.artfulsoftware.com/infotree/queries.php#78