O MyISAM funciona efetivamente no modo de confirmação automática (já que não é um mecanismo transacional) e apenas ignora a confirmação/reversão.

Na verdade, o mecanismo de armazenamento é uma camada diferente na arquitetura MySQL, separada do analisador SQL, a camada SQL se comunica com o mecanismo de armazenamento com API de nível inferior, e é por isso que existe um SQL e mecanismos comuns, suportando diferentes subconjuntos de recursos. Você pode ver uma visão geral de alto nível da arquitetura aqui