Você pode desativar as verificações de chave estrangeira:
SET FOREIGN_KEY_CHECKS = 0;
/* DO WHAT YOU NEED HERE */
SET FOREIGN_KEY_CHECKS = 1;
Certifique-se de NÃO usar isso na produção e tenha um backup.
SET FOREIGN_KEY_CHECKS = 0;
/* DO WHAT YOU NEED HERE */
SET FOREIGN_KEY_CHECKS = 1;