A subconsulta está sendo executada para cada linha porque é uma consulta correlacionada. Pode-se transformar uma consulta correlacionada em uma consulta não correlacionada selecionando tudo da subconsulta, assim:
SELECT * FROM
(
SELECT relevant_field
FROM some_table
GROUP BY relevant_field
HAVING COUNT(*) > 1
) AS subquery
A consulta final ficaria assim:
SELECT *
FROM some_table
WHERE relevant_field IN
(
SELECT * FROM
(
SELECT relevant_field
FROM some_table
GROUP BY relevant_field
HAVING COUNT(*) > 1
) AS subquery
)