Você pode usar mais de uma coluna para um
IN doença:SELECT s.period, s.year, s.amount
FROM salaries s
where (s.year, s.period) in (select year, period from periods)
Mas o
not exists de Gordon solução é provavelmente mais rápido. 
IN doença:SELECT s.period, s.year, s.amount
FROM salaries s
where (s.year, s.period) in (select year, period from periods)
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