Você pode usar o Visual Studio (o IDE completo) para fazer isso:

1. Use "Server Explorer" (no menu View) para se conectar ao seu banco de dados
2. Clique com o botão direito do mouse no banco de dados e escolha "Nova consulta" (ou encontre um procedimento armazenado para depurar)
3. Defina um ponto de interrupção (tecla F9 ou outra) em uma linha de SQL
4. Clique com o botão direito do mouse no editor SQL e escolha "Executar com depurador"