A maneira mais fácil de alterar o mecanismo padrão é fazer login no phpMyAdmin e, em seguida, vá para Variáveis >> mecanismo de armazenamento
clique em editar e digite InnoDB .
o mecanismo de armazenamento padrão agora é o InnoDB
http://dev.mysql.com /doc/refman/5.1/en/server-system-variables.html#sysvar_storage_engine
